Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tgfb1i1Q62219 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tgfb1i1Q62219 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tgfb1i1Q62219 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms