Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scn9aQ62205 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn9aQ62205 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn9aQ62205 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scn9aQ62205 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms