Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3a2Q62203 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3a2Q62203 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms