Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ssr4Q62186 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ssr4Q62186 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms