Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prg2Q61878 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prg2Q61878 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prg2Q61878 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms