Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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Fscn1Q61553 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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Fscn1Q61553 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fscn1Q61553 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Fscn1Q61553 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fscn1Q61553 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Fscn1Q61553 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Fscn1Q61553 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Fscn1Q61553 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Fscn1Q61553 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fscn1Q61553 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Fscn1Q61553 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Fscn1Q61553 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Fscn1Q61553 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fscn1Q61553 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fscn1Q61553 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fscn1Q61553 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Fscn1Q61553 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Fscn1Q61553 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Fscn1Q61553 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Fscn1Q61553 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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Fscn1Q61553 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Fscn1Q61553 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Fscn1Q61553 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Fscn1Q61553 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fscn1Q61553 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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