Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ecm1Q61508 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ecm1Q61508 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ecm1Q61508 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms