Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dsg1aQ61495 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dsg1aQ61495 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms