Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vsx2Q61412 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vsx2Q61412 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms