Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxd1Q61345 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxd1Q61345 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxd1Q61345 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms