Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
AcanQ61282 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AcanQ61282 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AcanQ61282 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AcanQ61282 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AcanQ61282 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1363.7 ms