Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nell2Q61220 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nell2Q61220 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nell2Q61220 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms