Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tsg101Q61187 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tsg101Q61187 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms