Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psen2Q61144 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psen2Q61144 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psen2Q61144 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms