Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prpf4bQ61136 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prpf4bQ61136 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
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