Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf3Q60980 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klf3Q60980 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 366 ms