Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Meis1Q60954 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Meis1Q60954 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms