Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vdac1Q60932 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms