Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdkn2dQ60773 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdkn2dQ60773 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms