Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Stxbp3Q60770 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stxbp3Q60770 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stxbp3Q60770 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms