Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Foxd4Q60688 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Foxd4Q60688 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms