Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2aQ60648 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm2aQ60648 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm2aQ60648 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms