Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CttnQ60598 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CttnQ60598 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CttnQ60598 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CttnQ60598 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CttnQ60598 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CttnQ60598 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CttnQ60598 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CttnQ60598 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CttnQ60598 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms