Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp20Q5XG71 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms