Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Uimc1Q5U5Q9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Uimc1Q5U5Q9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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Uimc1Q5U5Q9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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Uimc1Q5U5Q9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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Uimc1Q5U5Q9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Uimc1Q5U5Q9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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Uimc1Q5U5Q9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uimc1Q5U5Q9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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Uimc1Q5U5Q9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uimc1Q5U5Q9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uimc1Q5U5Q9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uimc1Q5U5Q9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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