Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ncoa4Q5U4H9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ncoa4Q5U4H9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ncoa4Q5U4H9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms