Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r196Q5SVD5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r196Q5SVD5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms