Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ankrd40Q5SUE8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms