Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms