Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TefmQ5SSK3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TefmQ5SSK3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TefmQ5SSK3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms