Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sun3Q5SS91 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sun3Q5SS91 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms