Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Phf12Q5SPL2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf12Q5SPL2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf12Q5SPL2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms