Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc85aQ5SP85 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc85aQ5SP85 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc85aQ5SP85 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms