Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trdv2-2Q5R1A4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms