Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trdv4Q5R1A3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trdv4Q5R1A3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trdv4Q5R1A3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms