Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp28Q5I043 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp28Q5I043 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms