Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prune2Q52KR3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prune2Q52KR3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prune2Q52KR3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms