Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q504N7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q504N7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q504N7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q504N7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q504N7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q504N7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q504N7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q504N7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q504N7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q504N7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q504N7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q504N7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q504N7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q504N7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q504N7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q504N7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q504N7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q504N7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q504N7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q504N7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q504N7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q504N7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q504N7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms