Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc84Q4VA36 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc84Q4VA36 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms