Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Srek1ip1Q4V9W2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Srek1ip1Q4V9W2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms