Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trappc3lQ4KL14 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms