Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mtmr11Q3V1L6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mtmr11Q3V1L6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms