Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ckap2Q3V1H1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ckap2Q3V1H1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ckap2Q3V1H1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms