Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc110Q3V125 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc110Q3V125 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms