Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ldlrad2Q3V0V0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldlrad2Q3V0V0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms