Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp48Q3V0C5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp48Q3V0C5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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