Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2fbQ3UWQ3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2fbQ3UWQ3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms