Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nr1d1Q3UV55 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nr1d1Q3UV55 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nr1d1Q3UV55 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms