Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chpf2Q3UU43 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chpf2Q3UU43 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chpf2Q3UU43 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms