Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Thsd4Q3UTY6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thsd4Q3UTY6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Thsd4Q3UTY6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms